29 mai : Des Rafale M F1 de la flottille 12.F rencontrent des Mig 29A Yéménites.
7 juin : Après avoir laissé dans son sillage Port-Saïd, dimanche, le porte-avions Charles de Gaulle a mis le cap sur le mer Egée. Lundi après midi, au terme de 24 heures de navigation, les côtes de la Crête se sont substituées aux dunes de sable qui bordent le canal de Suez. Le changement de climat est perceptible, le soleil et la chaleur du désert faisant place à un ciel grisâtre et un vent nettement plus frais. Après les températures caniculaires de la mer Rouge, l’équipage respire. Et, les couvertures refont leur apparition dans les postes, après avoir passées quelques semaines au placard. Bien que le retour au port se profile, l’heure n’est pas encore au repos. Si la mission Agapanthe touche à sa fin, pour les 1950 hommes et femmes du bord, les opérations se poursuivent, notamment sur le pont d’envol, avec le retour des catapultages de Rafale, Hawkeye et Super Etendard. Avant de regagner Toulon, le bâtiment a fait un crochet par la Grèce, afin de présenter le nouvel intercepteur de la marine à un pays désireux de renouveler sa composante aérienne. Dans le cadre de cette « mission de soutien à l’exportation », une démonstration fut organisée hier matin sur le Charles de Gaulle. Le navire a accueilli, entre autres, le Chef d’Etat-major de la marine et le président de la Commission de Défense de l’Assemblée nationale grecque. Un responsable de Dassault aviation était également à bord, l’avionneur espérant toujours une première commande étrangère de son appareil. Dans cette optique, la marine, qui exploite l’appareil depuis 2001, a apporté son concours. Trois des neuf Rafale embarqués ont effectué une démonstration devant les autorités grecques, en compagnie de quatre Super Etendard et d’un avion de guet aérien Hawkeye. Le moteur M 88-2 de Snecma, qui équipe l’avion de Dassault, a également été présenté sur le banc d’essais dont dispose le porte-avions.
9 juin : La Task Force 473 composée du porte-avions Charles de Gaulle, de la frégate antiaérienne Cassard, de la frégate anti-sous-marine Montcalm, du sous-marin nucléaire d’attaque Saphir et du pétrolier ravitailleur Somme reviennent dans leur port base de Toulon. Commandée par le contre-amiral Xavier Magne, la TF 473 avait quitté Toulon le 24 février 2006 pour la mission AGAPANTHE 06 qui représente le troisième déploiement du groupe en Océan Indien.
6 novembre : Le porte-avions Charles de Gaulle a appareillé de Toulon pour deux semaines d’entraînement au large de Toulon. Cette sortie comporte deux parties, dont la première, du 6 au 12 novembre dédiée aux qualifications des pilotes de l’Aéronautique navale. Durant cette semaine, de jeunes pilotes de Super-étendard et de Rafale appontent pour la première fois de leur carrière à bord du porte-avions, alors que des pilotes plus confirmés obtiennent leurs qualifications de nuit sur Super-étendard, Rafale et E-2C.
13 novembre : A midi pile, le porte-avions Charles de Gaulle a appareillé de Toulon pour poursuivre la campagne d'entraînement du groupe aéronaval. Le navire a quitté la base navale avec 5 Rafale Marine (dont 2 Rafale F2 les M11 et M12), 4 Super Etendard et 1 E-2C Hawkeye sur le pont.
13-24 novembre : Le porte-avions, accompagné des frégates Jean Bart, Tourville, La Motte Picquet et du pétrolier ravitailleur Meuse participe à l'exercice PEAN 06. L'objectif de cet exercice est d'entraîner le groupe à travailler ensemble.
23 novembre : Un hélicoptère Dauphin Pedro évacue, à la demande du CROSS Méditerranée, plusieurs membres de l’équipage du cargo français Scandola au large de Toulon. Cette évacuation sanitaire a lieu après repérage du Scandola par un avion de patrouille maritime Atlantique 2. L’une des personnes hélitreuillées, blessée, a pu recevoir des soins à bord du porte-avions.
4-15 décembre : Le Charles de Gaulle effectue des essais Hawkeye (Campagne Octopale – E-2C NP2000, organisée suite au changement des hélices du Hawkeye, pour passer d'une hélice à quatre pales à une hélice à huit pales). Le but de ces essais est la qualification de l'E-2C équipé des hélices NP2000 à bord du porte-avions Charles de Gaulle. Cette campagne fait suite à une campagne d'un mois qui s'est déroulée à Lorient en novembre au cours de laquelle le domaine de vol de l'avion a été exploré et les points critiques à vérifier à bord du porte-avions identifiés. Le but de la campagne actuelle est d'étendre ce domaine d'utilisation vers les basses vitesses de catapultage et d'appontage, de façon à optimiser l'utilisation de l'E-2C aux performances du Charles de Gaulle. La campagne d'essais comporte un certain nombre de vols d'essais, effectués à un rythme d'environ deux vols par jour, avec un briefing et un débriefing pour chaque vol. Sur toute la durée de la campagne, les pilotes doivent effectuer, au minimum, 22 catapultages, 22 appontages et 49 appontages avec TAG (Touch And Go). Tous ces vols sont effectués par un équipage, composé de deux pilotes d'essai, un TACAE chargé de la sécurité et un ingénieur naviguant d'essai. Une équipe de 34 personnes du CEV, du CEPA et de DCN assure la mise en œuvre de l'installation d'essais, de la télémesure et des caméras vidéo permettant de restituer avec précision la trajectoire de l'avion en sortie de pont. Au cours des vols d'essais, l'équipage essaie de déterminer les limites de l'avion. Par exemple, ils cherchent la vitesse minimum de sortie de catapulte, la vitesse maximum d'entrée dans les brins…Toutes ces informations sont importantes non seulement pour déterminer comment on utilisera le Hawkeye octopale, mais aussi pour déterminer comment il faudra utiliser le porte-avions. A l'aide de toutes les données ainsi obtenues, l'équipe d'essais pourra déterminer précisément le domaine d'utilisation, et indiquer quelles seront les difficultés pour les pilotes.
9 décembre : Deux leurres électromagnétiques Sagaie sont tirés, un avion bardé d’électronique étant venu jouer le rôle du missile ennemi.
10 décembre : Tirs Aster et Sadral sur des cibles GT 400 et SK 6 mises en oeuvre par deux Falcon 20 simulant les menaces.